يُعد مكتب التدقيق الداخلي الوحدة التنظيمية المسؤولة عن ضمان كفاءة وفعالية أنظمة الرقابة الداخلية وإدارة المخاطر في الهيئة. يقوم المكتب بتنفيذ مهام تدقيق مستقلة وموضوعية لتقييم مدى الالتزام بالسياسات والإجراءات المعتمدة، مع التركيز على سلامة العمليات المالية والإدارية والكشف عن أوجه القصور لتقديم توصيات عملية تسهم في التطوير المستمر. كما يزود المكتب الإدارة العليا بتقارير دقيقة تدعم اتخاذ قرارات استراتيجية مبنية على أسس علمية ومعايير نموذجية، بما يعزز الشفافية والحوكمة المؤسسية ويحقق أهداف الهيئة وتطلعاتها المستقبلية.

• إعداد وتنفيذ خطط التدقيق السنوية وفق منهجية تقييم المخاطر لضمان تغطية كافة الأنشطة الحيوية
  
  
• تقييم كفاءة أنظمة الرقابة الداخلية والإجراءات التشغيلية لضمان فعالية الأداء وحماية أصول الهيئة
  
  
• مراجعة مدى الالتزام بالسياسات والتشريعات المعتمدة لضمان ممارسة الأعمال وفق الأطر القانونية والإدارية
  
  
• إعداد تقارير التدقيق الدوري ورفع التوصيات اللازمة لمعالجة القصور وتطوير بيئة العمل المؤسسي
  
  
• متابعة تنفيذ ملاحظات التدقيق مع الوحدات المعنية لضمان الاستجابة الفعالة وتحقيق التحسين المستمر
  
  
• تقديم الدعم الاستشاري للإدارة العليا من خلال توفير بيانات دقيقة تعزز مستويات الحوكمة والشفافية