يُعد مكتب ضمان الجودة وحدة تنظيمية محورية تعمل تحت الإشراف المباشر لرئيس الهيئة، حيث يسهم في تحديد أفضل المواصفات وبرامج اعتماد التميز المؤسسي وفق التوجهات الاستراتيجية. يقوم المكتب بالإشراف الشامل على تطبيق متطلبات هذه المواصفات وإعداد الوثائق المرجعية المتعلقة بها، لضمان مواءمة الأداء مع أعلى معايير الجودة العالمية. كما يقدم المكتب الدعم الاستشاري والتقني للوحدات التنظيمية المختلفة لتعزيز ثقافة التميز، ويسعى إلى تحسين كفاءة العمليات الداخلية وتطوير منظومة الأداء المؤسسي، بما يرفع جودة الخدمات ويحقق الريادة والتميز المستدام في كافة مخرجات الهيئة

• ضمان امتثال الهيئة والمؤسسات التابعة لكافة المعايير والتشريعات الوطنية والدولية المعتمدة
  
  
• تعزيز ثقافة الجودة والتميز المؤسسي ونشر أفضل الممارسات الإدارية في جميع الوحدات التنظيمية
  
  
• تحليل البيانات والمخرجات التشغيلية لقياس رضا المتعاملين وكفاءة الأنظمة، واقتراح مبادرات التحسين المستمر
  
  
• إدارة منظومة الحوكمة المؤسسية ومتابعة المخرجات مع الإدارات لضمان دمجها في عمليات التقييم الدورية
  
  
• إدارة منظومة الصحة والسلامة المهنية في بيئة العمل بالتنسيق مع الجهات الخارجية ذات الاختصاص